維吾爾醫(yī)學(xué)有著悠久的歷史，如現(xiàn)存在柏林的回鶻文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，其中有一本內(nèi)容是醫(yī)治各種疾病藥方的通俗醫(yī)書(shū)，這本書(shū)雖然殘缺不全，但內(nèi)容仍較廣，包括有臨床各種癥狀和病癥，藥物治療、療法，以及其他資料，涉及的臨床各科有內(nèi)科、外科、皮膚科、婦科、眼科、牙科、泌尿科、耳鼻喉和精神病科，內(nèi)容包括各種疾病、癥狀共41種。

著名的古代維吾爾族醫(yī)學(xué)著作有回回醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)、回回藥方三十六卷、馬合爾哈肉孜米下衣、達(dá)司吐衣拉兒、醫(yī)學(xué)由司比等。

維吾爾醫(yī)學(xué)在發(fā)展過(guò)程中，不僅吸收了中醫(yī)學(xué)的精華，同時(shí)吸收借鑒印度、波斯、巴基斯坦、古希臘等國(guó)家的醫(yī)學(xué)精華，創(chuàng)造地發(fā)展了它的基礎(chǔ)理論藥物學(xué)和醫(yī)療技術(shù)。

維吾爾醫(yī)醫(yī)學(xué)理論過(guò)去長(zhǎng)期以“土、水、火、氣”為物質(zhì)基礎(chǔ)，以血津、痰津、膽津、黑膽津等“四津”體液學(xué)說(shuō)解釋人體與自然環(huán)境的關(guān)系，且還創(chuàng)立了一診斷和治療疾病的方法。在診斷方面與中醫(yī)的脈診有相同之處，常以“查脈”、“望診 ”、“問(wèn)診”等方法診斷疾病。分析脈象有10類35種，包括鋸木式、波浪式、蜥蝎式、釘釘式、鼠行疾促式等。內(nèi)科方面，常以內(nèi)服藥為主，一般將藥制成糖漿劑、膏劑，同時(shí)運(yùn)用熏藥、坐藥、放血、熱敷、冷水療、拔火罐、飲食醫(yī)療等11種療法。藥劑方面，有主藥和附藥之分。臨床常用復(fù)合劑，幾種藥進(jìn)行合成，多者用50味，少者用10味?？诜巹┲杏刑菨{劑、水果漿劑、丸劑、粉劑、膏劑、油劑、蒸餾劑、煎劑、浸劑、片劑等多種。

維吾爾醫(yī)在長(zhǎng)期發(fā)展中，經(jīng)過(guò)多人努力總結(jié)，逐漸在治療白癜風(fēng)、心腦血管疾病、精神病、骨科病、風(fēng)濕病、腸胃病、肝膽病、結(jié)石等疾病方面積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)，治療效果明顯。尤其在治療白癜風(fēng)方面，療效獨(dú)特。從宋元時(shí)期流傳至今，對(duì)白癜風(fēng)的治療是維吾爾族醫(yī)學(xué)有代表性的成果之一?，F(xiàn)在喀什、和田的維吾爾醫(yī)院，就是以治療白癜風(fēng)卓有成效而享有較高聲譽(yù)?！八沟┝孔⑸湟骸笔呛吞铼?dú)創(chuàng)的一種治療白癜風(fēng)的藥劑，治愈率達(dá)到80%，受到自治區(qū)有關(guān)專家的重視。

沙療也是維吾爾醫(yī)的重要組成部分，吐魯番的維吾爾醫(yī)醫(yī)院以其獨(dú)特的沙埋療法而享有聲譽(yù)?；颊呋蛱苫?、或跪或坐，將身體的一部分埋在滾燙的沙子中，接受治療。這種療法，對(duì)治療各種類型的關(guān)節(jié)炎、慢性腰腿疼、坐骨神經(jīng)痛、脈管炎、慢性附件炎等有明顯效果，對(duì)神經(jīng)系統(tǒng)某些疾病及輕、中度高血壓也有相當(dāng)療效。

新中國(guó)成立后，在黨和***的關(guān)懷下，維吾爾醫(yī)學(xué)有了新的發(fā)展，不僅有了專門的醫(yī)院和病床，而且增添了現(xiàn)代化的醫(yī)療設(shè)備，有了培養(yǎng)維吾爾醫(yī)的專門學(xué)校，整理出版了一些維吾爾文版的醫(yī)書(shū)?，F(xiàn)在南疆幾乎每一個(gè)地區(qū)都有維吾爾醫(yī)醫(yī)院。